Герб ФК «Нахичевань-на-Дону»
Герб представляет собой жёлто-золотой круглый щит. В центре герба находится стилизованное изображение исторического герба города Нахичевань-на-Дону. На левой части на серебряном фоне расположены в три ряда шесть золотых пчел. Смысл герба несложно понять. Пчелы указывают на трудолюбие народа, а улей – на обретение Нахичеванью и армянами новой родины. Серебро в геральдике символизирует чистоту, возвышенность, а зелень – цветение, возрождение, жизнь. Золото означает солнечную силу, мощь, богатство. На жёлтом поле щита надписи чёрным: вверху «ФУТБОЛЬНЫЙ КЛУБ», внизу «НАХИЧЕВАНЬ-НА-ДОНУ»; слева и справа два футбольных мяча.
ФЛАГ ФК «Нахичевань-на-Дону»
Флаг ФК «Нахичевнь-на-Дону» имеет основание золотого цвета с изображенным на нем крестом чёрного цвета, края которого простираются по всей длине и ширине флага.
Центр креста на флаге немного смещен вверх по вертикали.
На пересечении чёрных полос на кресте изображен герб ФК «Нахичевнь-на-Дону».